По приглашению правительства Австрии Международное агентство по атомной энергии (МАГАТЭ) и Организация Объединенных Наций по промышленному развитию (ЮНИДО) открыли в Вене свои штаб-квартиры в 1957 и 1967 годах, соответственно. В 70-е годы прошлого столетия правительство предоставило этим двум организациям постоянное местопребывание — Венский международный центр (ВМЦ). Для максимального использования нового комплекса в Вену из Нью-Йорка и Женевы были переведены другие подразделения Организации Объединенных Наций. Многие из них были объединены в Отделение Организации Объединенных Наций в Вене (ЮНОВ). После перевода из Бейрута в 1978 году Западноазиатского агентства Организации Объединенных Наций для помощи палестинским беженцам и организации работ его штаб-квартира временно разместилась в ВМЦ, где она находилась до перевода Агентства в город Газа в 1997 году. В марте 1997 года в ВМЦ была учреждена Подготовительная комиссия Организации по Договору о всеобъемлющем запрещении ядерных испытаний (ОДВЗЯИ).
В 1966 году правительство Австрии обратилось к Организации Объединенных Наций с предложением построить в Вене международный центр, который использовался бы организациями системы Организации Объединенных Наций. В 1967 году правительство Австрии и муниципалитет Вены совместным решением выделили для строительства такого центра участок на левом берегу Дуная. В 1968 году был организован международный конкурс архитектурных проектов комплекса зданий. Он вызвал интерес у архитекторов всего мира, и в итоге было представлено 288 проектов. По результатам конкурса победителем стал австрийский архитектор Иоганн Штабер. Его проект был официально представлен 18 декабря 1970 года канцлером Австрии. Строительство началось в 1972 году под общим руководством компании «Internationaler Amtssitz und Konferenzzentrum Wien». Расходы на строительство ВМЦ были распределены между правительством Австрии (65 процентов) и муниципалитетом Вены (35 процентов).
Торжественное открытие ВМЦ состоялось 23 августа 1979 года. 28 сентября 1979 года в Вене были подписаны отдельные соглашения между МАГАТЭ и Австрией и между Организацией Объединенных Наций и Австрией от имени ЮНИДО и других организаций системы Организации Объединенных Наций. Правительство Австрии передало комплекс ВМЦ Организации Объединенных Наций и МАГАТЭ за символическую сумму в один австрийский шиллинг (что сегодня составляет 0,07 евро) в год на 99 лет.
Комплекс ВМЦ, занимающий территорию в 180 тыс. кв. м, имеет экстерриториальный статус. Эксплуатационно-технические расходы ВМЦ покрывают базирующиеся в ВМЦ организации. В ВМЦ насчитывается примерно 4,5 тыс. кабинетов и 9 залов заседаний; здесь работают около 4 тыс. международных гражданских служащих примерно из 100 стран мира. Кабинеты располагаются в башнях высотой от 48 до 120 метров, имеющих форму буквы Y.
